I give reply in Russian:
How to fix URL for Category (early has been Section):
1. Открываем JoomSEF URL Manager на вкладке Manage SEF URLs
2. В отдельной вкладке открываем Менеджер категорий: Материалы
3. В третьей вкладке открываем Менеджер меню: Пункты меню - открываем то меню, которое будем чинить. Например "Обзоры и тесты"
4. В Manage SEF URLs ищем новый УРЛ, например "distributivy/distriby".
5. Заходим в него.
6. В поле New SEF URL вместо "distributivy/distriby" втыкаем старую ссылку из 1.5 "distributivi/"
7. Проверяем ID категории по Менеджер категорий: Материалы.
В поле Old Non-SEF Url вставляем index.php?option=com_content&id=126&layout=blog&view=category
126 - вместо этого числа подставляем ID нужной категории из 2.5
8. В поле Itemid вставляем ID пункта меню из Менеджер меню: Пункты меню
9. Сохраняем. Делаем то же самое для RSS и Атом, если они есть.
10. Проверяем, что все работает.
How to fix URL menu items:
1. Открываем JoomSEF URL Manager на вкладке Manage SEF URLs
2. В Manage SEF URLs ищем новый УРЛ, например "vakansii/uncategorised/vakansii".
3. Заходим в него.
4. В поле New SEF URL втыкаем старую ссылку из 1.5 "vakansii"
5. Сохраняем. Делаем то же самое для RSS и Атом, если они есть.
6. Проверяем, что все работает.
Articles with section in real path:
1. Открываем JoomSEF URL Manager на вкладке Manage SEF URLs
2. В Manage SEF URLs ищем "section" в поле фильтра Real Url.
3. Выбираем all filtered и удаляем эту хрень.